Nano'nun Günlüğü…

Ideallerimi gerceklestirmek icin arastiriyorum, Unutmamak icin yaziyorum!

Java ile Blosum62 Hesaplama

Gönderim Nisan 25th, 2014

Biyoinformatik alaninda protein dizilerinin hesaplanmasi konusu onemlidir ve dikkatlice yapilmasi gerekir. Dizi hizalamanin en onemli gorevi farkli DNA, RNA veya protein dizilimlerinin birbirine en cok benzer alanlarinin tespit edilmesidir. Dizi hizalamarinda temel yaklasim olarak hesaplama islemleri puanlama sistemine dayanmaktadir. Bunun icin en cok kullanilan algoritmanin BLAST oldugunu soyleyebilirim. Yapmis oldugum uygulamada, en basit seklinde bir Protein diziliminin hesaplamasi icin BLOSUM62 yontemini kullaniyor olucaz.

Makalenin Devamini Okumak Icin Tiklayiniz!… »

Etiketler: , , , ,
Bulundugu Konu Basliklari Akademik, BioInformatic, Java, Yazilim | Yorum Yok »

Istatistik

  • 1 Uye
  • 334 Yazi
  • 16 Yorum Var